В ядрах до 2.6.29 (не уверен!) этот протокол собирался отдельным модулем, поэтому его выключение было возможно помещением в /etc/modprobe.d/blacklist строчку blacklist ipv6.
В ядрах 2.6.30 протокол ipv6 собирался уже на уровне ядра и отключение его подразумевало пересборку ядра без оного.
В ядрах 2.6.31 хоть протокол и размещается в ядре, но предусмотрена возможность отключить его опцией при запуске ядра:
В GRUB'е первом ищем /boot/grub/menu.lst и дописываем строчку запуска ядра (кроме обычных опций ro quiet splash) ipv6.disable=1. Перегружаем компутер и проверяем ifconfig. В GRUB2 идём в /etc/default/grub и ищем строчку с опциями по умолчанию "quiet splash" и дописываем опцию ipv6.disable=1. Должно получиться вот так: "quiet splash ipv6.disable=1". И запускаем $ sudo update-grub.
Перегружаем компутер и проверяем ifconfig.
